石化是指有机物通过置换或有机物孔隙充填矿物而转化为石头的过程. 石化通过两种相似方式的结合——矿质充填作用和置换而发生. 硅化木是最常见的石化现象，但是所有有机质，从细菌到植物都可以石化. 相关的学科有地质学和埋藏学. 生物体形成化石都有一个掩埋过程. 否则就会被分解者分解，然后在风化作用下消失. 化石可分为实体化石、模铸化石、分子化石和遗迹化石四类，不同的化石有不同的形成方式. 实体化石是因为生物体被琥珀包埋，或被冰雪覆盖，或陷入沥青湖中，经碳化作用而形成. 有机物在成岩过程中，在一定温度和压力条件下，经过分解和蒸馏作用，其中的氢、氧、氮元素挥发逃逸、而碳元素留下来保存为以碳质为主较为稳定的碳质薄膜. 具有角质层、纤维质和几丁质薄膜的生物，例如植物、笔石、昆虫等更易经过碳化作用保存为化石. 而动物的内脏和肌肉等容易被氧化和腐蚀的软件则很难保存为化石. 完全矿化作用又叫矿物质填充作用. 通过这个过程产生化石，包含该样品的大量原始物质. 这个过程发生在地下水包含溶解矿物 ，充填该样品的孔隙，空腔，特别是骨头，壳或木头 . 当矿物从水中沉淀出来后，有机组织的孔被充填...阅读更多