故事发生在距今并不遥远的二十一世纪中期，主角林肯6-E(伊万·迈克格雷格 饰)和几百个伙伴生活在一个类似于乌托邦的地下社会中，在他们周围是先进的精密仪器，有条不紊的生活节奏和高效智能的防御系统，虽然终日不见天日，但根据基地科学家的描述，在他们的头上，整个星球已经被核战彻底地污染，已经没有任何生物能够在那里生存。
乌托邦的生活虽然一切井井有条，但自然和自由更令人向往，所有基地的居民都盼望着一个抽签的机会，幸运者将会被送到最后一个未被污染的地方，一个叫‘The Island’的世外桃源，而这一次获得这项荣誉的是林肯6-E的女朋友，美丽的乔丹2-D(斯嘉丽·约翰逊 饰)。由于基地管理者的疏忽，一只外面世界的飞蛾飞进了这座封闭已久的地下城市，它的出现令林肯6-E疑窦顿生，因为按照基地管理者的说法，所有的生物都在核战中灭绝了。
在飞蛾的带领下，林肯6-E来到了基地的中心，在那里他看到自己从前被选中前往‘The Island’的朋友斯塔克威泽，但展现在面前的并非描述中的美丽，基地的科学家正为他施行手术，他的器官被取出送出基地，至此林肯6-E终于明白：自己的生活其实一个巨大的谎言，他们都是被克隆组织控制的克隆人，他们存在的意义只是为本体提供新鲜健康的器官。
以动作片当家的好莱坞向来不缺牛×的动作片大导演，远到早些年拍《终结者》、《泰坦尼克》的詹姆斯·卡梅隆；近到以《指环王》系列打响的新西兰导演彼得·杰克逊和来自香港“外援”吴宇森，都是些叱咤风云、呼风唤雨的大腕级导演。而说到动作片导演，本片的导演迈克尔·贝也算得上一号，从《绝