常绿乔木，高达17 m；树皮紫褐色，平滑；生鳞叶的小枝扁平，排成一平面，二、三年生枝褐色，光滑，圆柱形。鳞叶2对交叉对生，成节状，生于幼树或萌芽枝上的中央之叶呈楔状倒披针形，通常长4~7 mm，宽1~1.2 mm，上面之叶蓝绿色，下面之叶中脉隆起，两侧具凹陷的白色气孔带。雄球花近球形，长约4 mm。球果近球形，熟时褐色，径2~2.5 cm。花期3~4月，种子翌年10~11月成熟。
喜光，但苗期耐荫；喜温暖湿润气候，能耐~12℃低温；适生于中性及酸性土上，在强酸性的红黄壤土亦生长良好。稍耐旱，在有伏旱的长江中游地区能安全度过，但不耐水涝。
播种繁殖。苗木出土前期要适当遮荫，并注意防止猝倒病发生，秋季要撤除遮荫多见阳光；当年苗高30 cm左右，留床过冬，次春进行移植，以后再经2次移植，待苗高3 m后可以定植；后期移植应带宿土，随起随栽，稍远距离移植需带土坨。
福建柏树形规整，鳞叶碧绿，在园林中可列植于大型建筑周围，配植于古典建筑门前或土丘之上。
福建柏的材质稳定、耐久性良好，是建筑、家具、细木工、雕刻的良好用材。