大林慈济医院急诊科于民国103年提升为急诊部， 下设急诊医学、观察医学、灾难医学三科。长期以来，本院急诊部与嘉义县紧急医疗网密切合作， 除了全天候24小时提供紧急伤病患的救护，同时亦是嘉义县灾难医疗救护基地、毒化灾设备储备医院， 服务范围更延伸到偏乡医疗站。因此本院急诊部也肩负着偏乡病患后送、山区救难、毒化灾难救治之责。
除了医疗，急诊部在教学和研究方面都有杰出的表现。本院为急诊专科医师训练医院，对后进医师专科能力之养成不遗余力，落实全人照护教育。
急诊病患病况常常紧急而复杂， 瞬息万变， 挽救生命往往在呼吸间， 良好的急救品质及服务才是上人创建慈院最大的目的。本院急诊部都是由训练有素， 阅历广博，学有专精的急诊专科医师为病患服务。急救处置有效率、有条理、掌握关键重点、运用工具、整合资源、与各专科的科际间合作亦无缝隙，且努力缩短诊断及处置的时程；俾使患者得到适时、适当的救治，提升治愈率，减少并发症。
急诊部同仁们无时不秉持着"守护生命， 守护健康， 守护爱"的宗旨为其终极职责。