虽然美国魔法国会（MACUSA）在纽特斯卡曼德（艾迪瑞德曼 饰）的协助下，成功的缉捕了强大的黑巫师葛林戴华德（强尼戴普 饰），无奈葛林戴华德很快就应证先前夸口的威胁，成功逃脱、并开始汇集对他终极目标一无所知的信众，开始培育纯种巫师好统治所有莫魔生灵。为了阻止葛林戴华德的阴谋，邓不利多（裘德洛 饰）招来答应协助他的前任学生纽特斯卡曼德，然而纽特对任务的危险性却一无所知。

邓不利多给予纽特在法国庇护所的指示，纽特和雅各（丹富乐 饰）将前往法国找寻蒂娜（凯瑟琳华特斯顿 饰）、奎妮（艾莉森苏朵 饰）及魁登斯（伊萨米勒 饰），必定投靠庇护所的主人尼乐勒梅。此时魔法世界日益分裂，就算在最可靠的朋友和最亲近的家人之间，感情持续面临重新定位，而忠诚度也不断面临挑战…。