在酷索维博物馆举行的“神秘侦探社”庆祝会上，展出了许多当年跟他们交手过的怪兽模型，像是“翼龙”、“黑骑士”、“面具怪物”、“一万伏特的鬼”... 突然跑出一个蒙面神秘客来搅局，整个展览场被搅乱得一团糟不算，还害得“神秘侦探社”的成员差点砸了自己的招牌。更惨的是，记者海瑟贾斯柏（艾莉西亚席维史东 饰）透过电视报导此事，更加深了镇民的恐慌，于是“神秘侦探社”决定让叔比狗跟薛吉留守在箱型车上，以便其余成员出马调查原委。
不过留守的这两位胆小鬼，这一次拿出勇气，下定决心证明自己也能破案，于是同步展开调查行动。所有的线索都指向曾是“黑骑士”组织成员的“老头”杰瑞米伟哥（彼得玻利 饰），当年“神秘侦探社”曾拆穿这群人的伎俩，将他们一网打尽。难道就是这位神秘人物心有不甘，决定大闹酷索维博物馆，好报一箭之仇吗？于是爱当老大的弗烈德（小佛莱迪普林兹 饰）与聪明的葳玛（琳达卡迪林尼 饰）、胡思乱想的黛芬（莎拉蜜雪儿吉兰 饰），再加上两个插科打浑随时都处于饥饿状态的叔比狗与薛吉，决定一同携手找出是谁放出这一大群的恐怖怪兽，将酷索维搞到天翻地覆的幕后蒙面神秘客。