王军志先后主持“863计划”“生物技术药物质量检测技术平台的研究”等22项国家级、省部级有关生物技术目标产品质量研究项目。2004年获得国家科技进步二等奖；2000年、2003年、2005年和2006年获得北京市科学技术二等奖；在国内外核心专业期刊上发表论文80余篇，主编《生物技术药物研究开发和质量控制》和《生物技术药物安全性评价》2部专著。负责完成了中日政府科技合作项目“国家药物安全评价监测中心”（国家1035工程重点项目）。 2010年11月任中国食品药品检定研究院副院长、中国药品检验总所副所长、研究员。[1] 2013年1月7日，在北京召开的2013年全国卫生工作会议上，中国食品药品检定研究院副院长、研究员王军志荣获白求恩奖章。2019年当选中国工程院院士。