目前常用的显像剂为18F-FDG，肿瘤细胞和炎症病灶以及良性肿瘤和恶性肿瘤对其的摄取具有一定差异性，根据放射性强度差异，可以对病变做出鉴别诊断；对于临床发现的原发灶不明的淋巴结转移病变，可以通过显示/不显示原发灶，从而诊断淋巴结病变为原发性还是转移性。

疗效观察可以分为两种，一种是早期观察肿瘤对治疗的反应，这个时候处于治疗过程中的病变可能形态学上尚未发生明显变化，但是功能代谢上往往已经有了改变，PET/CT可以早期（某些肿瘤可以在开始治疗1-2周即可发现变化）发现肿瘤有或没有这种变化，从而明确某种治疗手段对于该肿瘤有或无效。

另外一种是对于治疗结束后的治疗效果进行观察，比如放疗结束后局部验证反应尚未消退，或者手术后瘢痕形成局部解剖结构发生显著改变，此时CT或MRI检查局部有无肿瘤常常比较困难，相对而言PET/CT在此时更有利于检查有无肿瘤残留或者复发。

当然，PET/CT并不是万能的，其特异性、准确性等都有待进一步提高，实际应用中往往是多种互补手段一起使用以检查的目的，并在此基础上尽量降低花费。