署立新竹医院于2009年中通过癌症诊疗品质B级认证，至2010年初成立癌症中心，并于2011年7月改制成台大新竹分院，2013年9月由任务编组升级为一级单位“肿瘤医学中心”。改制之初，人心惶惶问题丛生，不管是办公场所的地理位置、相关人员的离职与衔接、医院管理阶层对癌症中心的定位不清楚，在在都成为有形、无形的困境。幸赖癌症中心全体同仁发挥忍耐到底、牺牲小我、顾全大局的精神，历经数月，才逐步将各项业务导入正轨。完成衔接期后，癌症中心全体同仁与时间赛跑、以最大的努力与毅力，克服许多有形、无形的困境，终于在2012年7月【通过】癌症诊疗品质认证，为该年度14家参与评鉴的区域级医院中，5家获得【通过】的医院之一。此一认证成绩，为本院日后拟升格为竹苗地区的医学中心，奠定了重要的基石。
配合国民健康署之要求，本院持续推动癌症预防筛检，除了将特殊个案写成新闻稿于媒体刊登，另外也自行设计卫教单张，希望以在地化的资料，鼓励民众参与筛检。对于不易推动的戒槟班，筛检小组推出动态性的戒槟课程，以提升民众参与戒槟的意愿。对于各项筛检成果，由癌委会主席在全院性会议中向所有医师做报告，提升医师参与癌症筛检之意愿。本院持续推动癌症预防筛检，不仅是强调数量的成长，更希望品质也能提升，特别是针对乳房摄影的ACR自我评量，筛检小组成员提出具体的改善措施，目前已有明显进步。
对于癌症登记，本院持续推动专业化，除了投入适当人力之外，还曾经聘请外部种籽师资到院指导，另外也至台大总院的癌登部门，进行各癌别的进阶学习，以确保本院癌症登记的品质与数量，符合医学中心的要求。目前已经与清华大学的统计所合作，将资料加以整理，将本院常见癌别的五年存活资料，回馈给多专科团队的成员，以做为未来相关癌别修订诊疗指引的参考依据。
本院目前有十一大癌症医疗团队(头颈癌、食道癌、胸腔癌、上消化道癌、乳癌、大肠直肠癌、肝癌、妇癌、泌尿道癌、血液肿瘤、儿癌)，每周召开会议，希望能提供最适当的治疗计划给每一位癌症病患。除此之外，本院也成立安宁共同照护团队，同时结合本院多专科团队、营养照护、门诊化疗、临床试验相关讯息及资源、个案管理师照护、癌症资源中心(营养咨询、社工心理咨询、社会福利资源)及癌症病友团体，提供全方位的癌症整合照护与社会资源连络，以期达到最有效率的治疗方式，并提高癌症病患的存活率及生活品质。
本院的经验获得国民健康署长官的肯定，于2012年12月8日在台中举办的‘2012年癌症诊疗品质提升计划----癌症诊疗标竿学习研讨会’中，应邀分享本院经验。此外，经由诊疗个管师的努力，本院将容易混淆的‘诊疗指引符合度’和‘治疗计划遵从度’做出了非常清楚的定义，并依据定义修订了各癌别的治疗计划书，为日后的癌症病历审查，奠定下明确的基础。
在化学治疗的安全性方面，本院在2012年将住院、门诊病患的化疗开立系统全面资讯化之后，每月持续监测以减少人为错误，并提升化疗安全。
癌症资源中心的业务稳定成长，未来希望能加强社会经济资源的结合，并加深个案照护的深度及符合病人需求。在营养照护方面，持续提供专业的咨询，对于特殊疾病的患者进行专案研究，期待未来能有学术发表。