随着各种新发感染性疾病的涌现及新型抗生物制剂的临床试验，临床微生物室所肩负的职责和使命日益突出。微生物室提供的数据对这些疾病和新生药物的诊疗起了关键性的作用，加强住院患者的临床微生物检验与监测，对于预防和控制医院感染起着十分重要的作用。
传统上认为寄生虫病属于热带病范畴，但事实证明，经济和社会条件对寄生虫病流行的影响远大于气候的影响。在不发达地区，特别是乡村贫困人群中，一种或多种寄生虫同时感染的现象屡见不鲜。
微生物对化妆品的污染，不仅会引起化妆品变质(比如变色、变稀、霉斑等);更严重的是，它很有可能刺激皮肤、眼睛等脆弱部位，引发毛囊炎、败血症，重则还有可能危及消费者的生命健康安全。因此，各国都制定了化妆品中微生物的卫生标准，将其作为一个重要的产品质量指标，以防止和控制微生物对化妆品的污染。
最近几年来，随着卫生微生物检验的国内交流、国际交流较广，并且引起了许多先进的仪器设备，大大提高了卫生微生物检验水平，然而，我国药品卫生微生物检验工作中出现了一些问题，这些问题在很大程度上降低了我国药品微生物检验质量，甚至对临床用药造成了很大的影响。