房地合一税新规上路，针对特定股权交易样态，财政部最新函释认定，如果是间接持股且股权未过半，可按关系企业各层持有比率，相乘计算持股情形，最后合并计算影响力，作为认定房地合一税申报义务的标准。
房地合一税2.0从去年7月1日起生效后，除了加严短期持有的规定之外，更将预售屋、符合一定条件的股权交易，纳入房地合一的课税范围，也就是当股东出售其持股（或出资额）过半数的公司股权时，这间公司又有50%以上的价值，是由我国房屋、土地所构成时，这笔交易就算是不动产交易，应课征房地合一税。
财政部赋税署表示，未来在认定特定股权交易时，无论是直接持股、间接持股，最上层股东，皆有可能成为房地合一税的课税对象。
其中以直接持股的情形最单纯，个人或营利事业直接持有国内外公司的股份或出资额，直接依持有比率是否过50%，认定该不该课税。
但间接持股的情形，状况就复杂不少，官员表示，原则上，判断依据会依关系企业当中，各层持有股份或出资额的比率，相乘计算整笔交易的持股比率；接着各类直接及间接持股的情形，须合并计算持股比率。
举例来说，甲公司持有乙公司40%股权，但可实质控制乙公司；同时甲公司、乙公司各持有丙公司（资产价值以不动产为主）40%及60%股权。
在上述情境中，当甲公司跟买家谈妥合约，打包出售全集团持有的丙公司股权，相当于出售64% [40%+(40%×60）]丙公司股权，符合“出售持股或出资额过半数”的法定要件，应课征房地合一税。
官员强调，本次函释不只要求关系企业须合并计算影响，更将关系紧密的个人，也纳入个人特股股权交易的认定范围，像是个人的配偶、二亲等以内家人，以及上述人士所控制的关系企业，皆应在交易不动产性质的公司时，合并计算对该公司的影响力。