WinSCP 同时也支援 SCP 通讯协定。它主要的功能是安全的在电脑间传输档案。WinSCP 也可做为一般的 FTP 用户端使用，同时它也支援命令列执行，可帮助我们做一些自动化的动作，例如：同步、上传、下载……等。

WinSCP 可以做所有简单的档案操作，包括下载与上传档案。它也可以重新命名档案与资料夹、新增资料夹、变更内容、建立目录连结 (symbolic links) 与捷径。

两种程式界面可供选择，让使用者甚至可以管理自己电脑上的档案。WinSCP 有两种可以选择的操作界面与许多的设定选项。

在安装时就会有机会选择您所希望的的操作界面。您也可以在选项里面改变它。若您第一次使用 WinSCP，您可能会希望选择您比较熟悉的档案总管式操作界面。或是您习惯被应用在许多档案管理程式中 (像是 Total Commander、FAR、Altap Salamander) 的 Norton Commander 概念的双窗界面，选择这个操作界面。双窗界面的设计让您可以简单的用键盘操作程式；您甚至不用碰触鼠标。使用此界面可以更快的操控程式。