卫生署于3月19日(星期一)上午10时假疾病管制局B1大礼堂举办“95抗登革专案指挥中心有功人员颁奖典礼”，由指挥官侯胜茂署长主持，邀请参与“95抗登革专案”的环保署、内政部、教育部、国防部、交通部、经济部、财政部、行政院新闻局等部会及中央健康保险局、卫生署中医药委员会等单位出席，由侯胜茂署长颁发感谢状，感谢各单位在95年底至今年初“登革热中央流行疫情指挥中心暨前进指挥所”运作期间的努力与辛劳，并颁发专案奖章嘉勉指挥中心有功人员。
95年的登革热疫情，从入夏以后发生跨县市流行，当时即依据传染病防治法于95年10月2日成立“登革热中央流行疫情指挥中心暨前进指挥所”，积极整合防疫资源，希望能迅速有效控制疫情。由于相关部会的密切合作，指挥中心得以充分发挥协调整合、运筹帷幄的功能，再加***与地方政府的积极作为，在指挥中心运作三周后，登革热整体疫情呈现下降趋势，主要流行地区疫情已在控制之中，行政院因此核定于12月22日解除指挥中心任务，为“95抗登革专案”完美画下句点，也为中央流行疫情指挥中心的运作，建立了良好的合作模式。各单位借由这次并肩作战的经验，对于未来各种可能发生的传染病流行，预期会有更好的合作默契与因应作为，为民众营造一个免于传染病威胁的生活环境。