为提升台湾禽畜产业之竞争力，结合畜产科学与生物科技，培育具备种畜禽遗传育种改良技术、高效率繁殖生产技术、现代化禽畜舍规划与饲养管理技术、饲料配方设计与制造技术、安全畜产品开发与利用技术、实验动物饲养管理技术及永续禽畜场管理技术等专业人才。同时，应用理论与实务并重之课程模组，养成兼具社会道德伦理与多元文化素养之现代化经济动物生产之技术管理人才，以开拓畜产业之新契机。
应用理论与实务并重之课程模组，聚焦“动物营养饲养”、“动物繁殖生理”、“动物遗传育种”及“畜产品加工利用”等四大专业主轴，着重具现代化禽畜生产与永续经营，并兼具动物福祉之畜产科技产业专业应用人才之培育。
以系所四大核心主轴课程结合各领域之专业应用，循序渐进提升学生之执行力与创新研究能力，培育具备生产力4.0与大数据应用分析，并养成具国际观永续经营之畜产科技产业链高阶专业人才。