研究院以水污染治理、水生态修复、水资源保护、土壤修复、污泥处置、水处理药剂和污水与河道治理生物制剂研发等为主导，通过汇聚各方科技创新资源，开展技术研发、平台建设、项目孵化、项目投资、成果转化及产业化等工作，形成覆盖水处理、污泥处置和土壤修复药剂等多领域技术集群，建设开放式创新、创业、孵化和成果转移转化平台，吸引和孵化一批环保高科技和专业服务型企业，集聚和培养一批高层次创新创业人才。努力将研究院和公司建设成为南京市六合区环保产业研发孵化高地、南京师范大学和科盛环保科技股份有限公司的重要科研成果转移转化基地，打造成江苏省环保领域重要的创新研发和产业集群基地。