沿近海渔业资源养护、利用政策之拟订、协调、督导及管理。
沿近海渔场保护、利用、改造政策之拟订、协调、督导及管理。
沿近海特定渔业管理政策之拟订、协调、督导及执行。
沿近海渔业巡护政策之拟订、协调、督导及管理。
沿近海渔业监控、管制与侦查政策之拟订、协调及督导。
娱乐渔业政策之拟订、协调、督导及管理。
特定、娱乐渔业渔船建(改)造与本国籍渔船输出入之管理及督导。
渔船用油补贴政策之拟订、协调、督导及执行。
渔船船员政策之研析、法规研拟、协调及督导。
受雇沿近海渔船之本国籍船员证照核发、协调及督导。
受雇沿近海渔船之非本国籍船员管理及督导。
渔船(员)动员准备之协调及督导。
两岸渔业事务之策划、协调及处理。
其他有关沿近海作业渔船船员管理及督导事项。
专用渔业权变更、撤销及停止之处分。
渔业权处分补偿之核定。
涉及二县(市)渔业权渔业作业纠纷之调处。
定置渔业权之协调及督导。
其他有关渔村建设及专用或定置渔业权渔业事项。
渔业法规制(订)定、修正之研议及审议。