水稻研究所设有水稻遗传、杂种优势利用、生物技术、品质改良、种子工程、栽培和生理7个研究团队。其中，教学科研人员33人，实验助理、科研助理和工勤人员38人。在岗科研人员中，教授14人、副教授13人，具有博士学位的31人。现有国家杰出青年科学基金获得者1人，长江学者青年学者1人，国家百千万人才工程国家级人选2人，享受国务院政府特殊津贴专家4人，四川省科技杰出贡献奖获得者1人，天府万人计划人才2人，四川省学术和技术带头人8人，四川省有突出贡献的优秀专家3人。拥有农业部“长江上游水稻种质改良与创新利用”团队、四川省青年科技创新研究团队、水稻遗传育种四川省国际科技合作基地和四川省劳模创新工作室。
研究团队成员如下表，更多详情请参见“研究团队”。