中科院鄱阳湖湖泊湿地研究站现有基础条件包括南部园区综合实验楼和北部园区综合楼各一栋，园区占地面积为75亩，建筑总面积约4300 m2。其中实验室部分已建有生物实验室、生态实验室、化学实验室、水文实验室、分析仪器室、前处理室、药品储藏室等共600m2。生活区部分有30个房间，可以进行大小学术会议、客座研究人员住宿、站内工作人员公寓、洗衣房、配电房、办公室等各种功能。宽带网络、网络电视、办公条件齐备，完全可以满足来站科研工作及学术交流人员的基本需要。室外试验场地包括气象观测场、水热通量观测场、湿地生态试验场、野外湿地水文生态自动观测系统。配备实验室分析仪器42台套，野外便携式观测仪器58台套，固定资产总价值1500多万元。配备野外科学考察船一艘，越野考察车一辆，可以满足水环境、水生态、湿地土壤、湿地植物长期定位观测及科研任务需要。