《宝可梦 晶灿钻石》《宝可梦 明亮珍珠》的冒险舞台位于“神奥地区”。在这片绿意盎然的大地上，巍峨的天冠山耸立于中央，而且有诸多神话流传下来。主角将探访“神奥地区”内的各个地方，以成为宝可梦联盟的冠军为目标。
城镇和道路等场地细腻地以《宝可梦 钻石／珍珠》的尺寸重现。曾经游玩过原作的人，能带着回忆再次踏上熟悉的地方，重温那段冒险之旅；初次来到神奥地区冒险的人，也将在这段旅途上遇到许许多多的邂逅和惊奇。
主角会从“草苗龟”“小火焰猴”“波加曼”之中挑选1只宝可梦作为最初的伙伴，踏上冒险之旅。在《宝可梦 晶灿钻石》的冒险旅途中，主角将遇见传说的宝可梦“帝牙卢卡”，在《宝可梦 明亮珍珠》中，则会遇见传说的宝可梦“帕路奇亚”。