本校前身为国立屏东农业专科学校，设校之宗旨在培育国内农业相关产业所需各方面人才为主，并协助政府推动各项农业政策及发展农产事业，改进所需相关研究与发展，因而设立与农业工程相关之科系。
由于配合国家发展需要与工商社会之发展，本校于民国八十年改制为“国立屏东技术学院”，同时成立工学群相关科系，再于民国八十六年八月更名为“国立屏东科技大学”，工学群则组织成立为工程科技学院(简称工学院)，包括：
培育兼具专业知识、实务技术、人文素养、国际视野并能够进行终身学习以及社会关怀的工程人才。
(一)专业知识：具备跨领域基础科学暨各专业工程知识以及能进行工程问题分析暨解决以及沟通表达之能力。
(二)终身学习：具备持续学习科学与专业工程知识的能力。
(三)人文素养、社会关怀：具备对人文道德伦理、科技法律及社会公义的基本认知。
(四)实务技术：具备工程实务与执行能力。
(五)国际视野：具备接轨国际、了解国际工程技术发展趋势之能力。