《应用及环境微生物学》（Applied and Environmental Microbiology，简称AEM）为美国微生物学会所发行的双周科学期刊，具同侪审查机制。本刊物创始于1953年，原名《应用微生物学》（Applied Microbiology），1975年改为今名。本期刊属于延迟开放获取期刊，发行前六个月需要付费注册才能阅读，六个月后转为开放获取，意即读者可以免费下载论文。根据期刊引证报告（JCR），该期刊2014年的影响因子为3.668[1]。该期刊在微生物及医学领域，为过去百年最具影响力的100种期刊之一[2]。现任总编辑为拜罗伊特大学的Harold L. Drake。