qy88千嬴国际官网拥有水利工程一级学科博士学位授予权和水利工程专业硕士学位授予权，共有7个工学博士点、9个学术学位硕士点，水利工程和工程管理2个专业学位硕士点。学院现有博士研究生导师79人（其中南京水利科学研究院联合培养导师11人），硕士研究生导师72人。

学院现通过硕博连读、直博生、考核选拔等多种方式招收博士研究生，近三年每年约招收70人；通过推荐免试和全国统考招收全日制硕士研究生（包括全日制学术学位硕士研究生和全日制专业学位硕士研究生），通过全国统考招收非全日制专业学位硕士研究生，近三年每年招收约全日制硕士230人。目前在校研究生871人，其中留学生5人。

学院近三年共派出43名研究生出国联合培养或攻读学位；2016年开始，学院与南京水利科学研究院联合培养博士研究生，目前已招收10名联合培养博士研究生；学院还在长江水利委员会长江勘测规划设计研究院等单位建立了研究生工作站、研究生实习实践基地。