无尾港水鸟保护区成立已届十三个年头，在一切基础资料记录、监测等资料匮乏下，让许多关心保护区的民众或团体无所适从，但这十几年来，经过许多人的努力及公部门的支持，这些重要的资讯也慢慢的建立，做为保护区日后经营管理的参考及指标。

无尾港文教促进会，累积十年的经验及在地的精神，从2000年开始记录及普查保护区之鸟况，也因便利的地缘关系，采频率较高的调查方式，取得更确实的鸟况记录，以利县府在保护区内栖地上的管理及操作。

从五十年代湍急水流的感潮型形态，到慢慢堰塞的草泽型湿地，无尾港事实上是一个变化速度相当大的保护区，其间生物多样性的变化，如何我们不得而知，然保护区内部的恶化，却是有目共睹的，未来这也是最迫切的课题。