赖氨酸在体内的功能有：参与体蛋白如骨骼肌、酶和多肽激素的合成；是生酮氨基酸之一，当缺乏可利用的碳水化合物时，可参与生成酮体和葡萄糖的代谢（在禁食情况下，是重要的能量来源之一）；维持体内酸碱平衡；作为合成肉毒碱的前体物，参与脂肪代谢；另外，赖氨酸还可以提高机体抵抗应赖氨酸是合成体蛋白不可缺少的成分，在酶蛋白、生殖细胞、骨骼肌及血红蛋白等的形成中具有非常重要的作用，同时也是某些多肽激素的组分之一；赖氨酸参与体内能量代谢过程，是生酮氨基酸之一，当体内缺乏碳水化合物时，可被分解为葡萄糖或；赖氨酸也是酯代谢中肉毒碱的前体物质，在脂肪代谢中发挥着重要的生理作用。