棉花是耐盐碱作物之一，是新疆主要栽培作物，也是该地区发展的优势经济作物。一般认为，棉花的幼苗阶段和开花结铃期对盐分比较敏感。土壤盐分较高，对棉花出苗和出苗后的生长产生盐害，破坏棉花养分离子吸收，严重时会使幼苗受到盐分胁迫导致死亡，造成棉花保苗率低，影响棉花产量。然而，随着外界环境条件的改变及培育耐盐碱棉花品种，棉花的耐盐性可能有一定的改变。

在盐碱地区域种植大面积的棉花需要优先选择耐盐碱和耐密植的品种，对于大铃的棉花品种来说，需要保证每667m2种植8万铃以上，而中铃和小铃的棉花品种则需要适当根据品种的生长特性，在保证生长空间的基础上适当增加种植铃数。

一般而言，棉花较其他作物具有更好的耐盐碱性，但是在种植的过程中如果盐碱度过高还是会对棉花的产量带来一定的影响。为了保证棉花高产，在种植之前需要施加适当的有机肥对种植区域的盐碱度进行调节，以便于更加适宜棉花生长。棉花种植对棉田的地力条件也有一定的要求，地势要相对平坦，土层需要具有一定的厚度，能够为灌溉提供良好的条件等。为了促进棉花根系生长，需要采取深耕深翻的整地措施，尤其是冬季过后，可以起到加速冻融的作用，保证土壤处于疏松状态，进而为棉花根系提供良好的生长环境。