一般情况下，引起舌头根长好多小疙瘩的原因有很多，例如舌乳头炎、扁桃体发炎等。患者应当前往医院，在医生的指导下通过应用药物、手术等方式进行治疗。

1.舌乳头炎

舌乳头炎通常是由于机体的内分泌失调、维生素的缺乏或者真菌感染等原因引起，患者通常会在舌头根部长出许多小疙瘩，可以应用头孢曲松、氯己定含漱液等药物来进行治疗，如果病情严重，还可以通过手术的方式来进行治疗，切除舌乳头，根除病灶。

2.舌扁桃体炎

舌扁桃体炎通常是由于患者的饮食不当等原因引起，舌扁桃体会出现充血、肿胀等症状，如果没有得到及时的治疗，舌扁桃体局部会出现增生的情况，进而导致患者出现舌头根长了好多小疙瘩的症状。患者可以遵循医嘱，通过应用阿莫西林、青霉素等药物来进行治疗。