毛囊根部发痒可能与以下因素有关：个人卫生不注意，导致皮肤汗液和污垢积聚；毛囊炎，一种以毛囊为中心的炎症性疾病，常由细菌、真菌等病原体感染引起，患者可能出现红色丘疹或脓疱疹，并伴有瘙痒，可发生在任何有毛发的区域；蠕形螨病，一种影响毛囊和皮脂腺的疾病，通常由寄生于人体的蠕形螨引起，典型症状包括红斑、丘疹，可能伴有皮肤瘙痒和刺痛感，部分患者也可能出现毛囊根部发痒的情况。

在排除生理因素后，导致毛囊根部发痒的原因有很多种可能性。建议患者就医检查，以明确病因。