IgE是造成即时型过敏症中臨床表现的原因,在異位性皮肤炎或气喘等过敏性疾病,血清中IgE浓度通常与所暴露过敏原的强度及过敏症狀的严重程度相关。因此测定IgE浓度有助于诊断过敏性疾病,检验血清中IgE浓度对评估儿童的过敏性症狀尤其重要。在寄生虫疾病中也可发现血清IgE浓度明显上升,在极罕見的IgE骨髓瘤患者体内的IgE浓度也非常高。许多先天的,特别是细胞部分的免疫缺失疾病,与人類免疫不全病毒进一步感染时都会出现偏高的IgE浓度,而其他免疫缺失疾病中通常IgE浓度很低或根本测不到。因此测定IgE浓度对于免疫缺失的鉴别诊断相当重要。