大学部课程校定必修二十八学分，系共同必修六十六学分

大学部课程校定必修二十八学分，系共同必修六十六学分，最低毕业学分为一四十学分。大学部之教学为了适应未来本系之发展，规划有三个学群(两个主/次要群及辅助学群)， 分别为：系统与控制学群(主/次)；设备与设计学群(主/次)；生物产业基础与应用学群(辅)。每位学士班之学生毕业前必须选修主要学群六门课、次要及辅助学群各三门课。硕士班至少应修毕三十学分（含六学分论文），研究生可依其兴趣专长选择 相关主修领域规定之课程学分，且应修毕数学或统计学等相关课程达六学分以上。 本系设有硕、博士班，以积极培育以下领域之人才为教学与研究方向：

生物与奈米、微机电等科技之结合研究。

本系学生毕业后依其兴趣及特长可朝各方面发展， 除可继续在国内相关研究所进修，亦可出国深造，就业方面以进入民间 高科技产业为主，或可参加政府举办之各种相关类科考试，进入政府有关机构就业，如农业试验所、农业改良场单位任职、或在学术单位担任教职等。

“生物产业机电工程”是将机械、电机、资讯、机电整合、电子化及各种工程技术应用于生物产业上。本世纪为生物科技产业之蓬勃发展时代，生物产业涵括传统之农、林、渔、牧及新兴之生技产业如环保、特化、医药、生物材料、检测等。因之，本系之教学目标及任务为培养生物科技产业发展所需之各类工程人才，以促进生物科技产业之快速发展。