期刊荣誉： 1989年，获得全国高等学校自然科学学报优秀编辑质量一等奖。 1990年，获得四川省首届科学技术期刊优秀期刊一等奖。 1993年，获得四川省第二届科学技术期刊评比优秀期刊一等奖。 1995年，获得四川省十佳科技期刊奖。 1997年，在第二届全国优秀科技期刊评比中获得一等奖。 1999年，获得首届国家期刊奖提名奖。 2002年，获得第二届国家期刊奖百种重点期刊奖。 2006年，获得教育部中国高校精品科技期刊奖。 2010年，获得教育厅首届四川省高校精品科技期刊奖
《四川大学学报（医学版）》创刊于1959年，是由中华人民共和国教育部主管，四川大学主办的综合性医学学术期刊，主要刊登基础医学、临床医学、口腔医学、预防医学、药学、法医学等方面的研究成果及医疗技术的创新与改进等。
据2018年6月《四川大学学报（医学版）》官网显示，《四川大学学报（医学版）》编委会共有编委65人。
据2018年6月1日中国知网显示，《四川大学学报（医学版）》出版文献共7932篇、总被下载775199次、总被引38582次；（2017版）复合影响因子为0.932、（2017版）综合影响因子为0.713。
据2018年6月1日万方数据知识服务平台显示，《四川大学学报（医学版）》载文量为4877、被引量为24998、下载量为122373；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《四川大学学报（医学版）》影响因子为0.96，在全部统计源期刊（6735种）中排1127名、在大学学报（医药卫生）（114种）中排第28名。
据中国知网收录信息显示，1978年该刊由半年刊变更为季刊。
据中国知网收录信息显示，1979年该刊由季刊变更为半年刊。
据中国知网收录信息显示，2004年该刊由季刊变更为双月刊。
2014年11月，该刊成为国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。
据2018年6月1日中国知网显示，《四川大学学报（医学版）》出版文献共7932篇。
据2018年6月1日万方数据知识服务平台显示，《四川大学学报（医学版）》载文量为4877。
据2018年6月中国知网显示，《四川大学学报（医学版）》是北京大学《中文核心期刊要目总览》（1996年第二版、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）来源期刊，被JST 日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、CSCD 中国科学引文数据库（2017-2018年度）（含扩展版）等数据库收录。
1989年，获得全国高等学校自然科学学报优秀编辑质量一等奖。
1990年，获得四川省首届科学技术期刊优秀期刊一等奖。
1993年，获得四川省第二届科学技术期刊评比优秀期刊一等奖。
1995年，获得四川省十佳科技期刊奖。
1997年，在第二届全国优秀科技期刊评比中获得一等奖。
1999年，获得首届国家期刊奖提名奖。
2002年，获得第二届国家期刊奖百种重点期刊奖。
2006年，获得教育部中国高校精品科技期刊奖。
2010年，获得教育厅首届四川省高校精品科技期刊奖、第三届教育部中国高校精品科技期刊奖。
2012年，获得第四届教育部中国高校精品科技期刊奖。
2014年，获得第五届中国高校精品科技期刊奖、第二届四川省高校精品科技期刊奖、2014中国国际影响力优秀学术期刊奖。
2015年，获得RCCSE中国权威学术期刊（A+）、2015中国国际影响力优秀学术期刊。
2016年，获得第三届四川省高校精品科技期刊奖。
2017年，获得2016年度中国高校百佳科技期刊、2016中国国际影响力优秀学术期刊。
据2018年6月万方数据知识服务平台显示，《四川大学学报（医学版）》获得过全国优秀科技期刊一等奖、四川省十佳期刊，第一、二、三届四川省科技期刊优秀科技期刊一等奖。