以灰白色墙身、碧绿色屋瓦建造的二层楼建筑是澎湖水族馆，它位于澎湖的白沙乡岐头村，是由原来的水产试验所扩建而成。馆内规划有滨海生态、礁岩池、大洋池生态等展示区，其中最受瞩目的就是长达14米的拱型海底隧道，您可以漫步在隧道中，欣赏各种海底生物。水族馆大门正对面，有一段笔直地朝台湾海峡延伸出海的波浪海堤，当初是日本珍珠养殖公司辟建的养殖场，由于海堤特别的波浪形状，吸引许多的游客前来拍照。不过，想要在蔚蓝海水中的拍照的话，记得先看好潮汐时刻，挑对涨潮时间来才拍得到，不然脚下就只会有一片潮湿的泥滩地！在水族馆东侧还有一座利用潮差设计建构的岐头亲水公园，里面有潮间带漫步活动区，潮差圆形戏水池和儿童游乐设施，可以让大人、小孩一起观察潮间带生物和了解潮汐作用，是个寓教于乐的游憩区。 详细说明详细说明-显示或收起长内容

馆内有触摸池、鱼儿啄菜等，每天上午及下午两个时段在大洋池都有精彩的喂食秀，可以看到饲育员和海洋生物们的有趣互动。