龙岩市第二医院前身为1898年在厦门鼓浪屿创办的救世医院，后改名为厦门鼓浪屿医院。1970年3月迁往龙岩，改称福建生产建设兵团一师医院，1974年易名为福建生产建设兵团龙岩煤矿医院，1975年更名为龙岩地区煤矿医院，1977年由龙岩地区行政公署接管，改名为龙岩地区第二医院。1997年5月1日，龙岩撤地建市，医院随之更名为龙岩市第二医院。
目前，医院展开床位1500张，年出院病人5万余人次，年手术2万余例次。是福建医科大学、福建中医药大学等多所医学院校的临床教学医院。是福建省卫计委批准的内科、外科、妇产科、儿科、麻醉科、放射科和全科医学科住院医师规范化培训基地。医院拥有一流的诊疗设备：全省独有的美国特力智能传输轨道物流系统，共设39个站点。