保税物流是现代物流产业发展的一种新兴形态。深圳海关支持企业在保税区、出口加工区等特殊监管区域拓展保税物流功能，满足了即时生产、零库存、网上订货等新型生产、运输和经营方式的需求。深圳海关还在支持下鼓励和引导企业在海关特殊监管区域和保税监管场所内设立高端产品研发中心、检测维修服务中心并开展仓储、配送、分拨等物流服务，以此延长产业链，提高附加值，有效地帮助企业降低经营成本。

依托珠三角的区位和的海港优势，近年来深圳已基本建成了集装箱枢纽港、华南地区航空门户机场和亚太地区重要的物流枢纽城市。深圳物流的运行效率全国，已经接近全球中等发达国家的物流运行水平，截至2010年，深圳市物流企业增加值达到900亿元，占GDP比重为9.67%，同比增长14.07%。为了推动深圳现代物流业的持续快速发展，增强物流业对深圳经济增长的拉动作用，深圳海关不断改革创新，努力推动深圳发展建设成为一个国际性物流枢纽城市。