试行办法中也存在一些有争议的条款。针对这些问题，科技处对科研工作量计算试行办法进行了进一步的修正，对有争议的条款进行细化、明确。为使2008年度科研工作量计算更科学、更合理，并能与科研管理系统工作量计算相对应，现通知对2008年度科研工作量进行重新填报，由此给各位老师带来的不便敬请谅解。
具体事宜如下：
一、统计范围不变，仍为：2008年1至12月各类科研成果，包括科研项目、学术论文、被采纳的咨询调研报告、著作、艺术作品、知识产权、鉴定验收项目、获奖成果等；所有成果须以厦门理工学院为署名单位。
二、科研工作量计算试行办法中修正明确部分：
其中： 实际到校的科研经费数值，以万元为单位，包括实际拨入我校经费和学校实际配套经费。
2、科研立项工作量按其立项年度一次性给予，不再根据其研究时间分摊。
注：对于2008年之前立项，但计划结题时间在2008年之后的项目，则按如下公式一次性计入2008年工作量：
科研项目立项工作量 × 研究剩余年份 / 研究时间所跨越年份。
3、两人或多人合作的科研课题、科研成果（论文与著作除外）及科研水平分，由项目负责人按各人实际贡献分配工作量。项目组中的校外人员不参与分配；对于我校柔性聘用的，不列入学校岗位考核的人员，不计算科研工作量，也不参与科研工作量的分配。
4、著作由两人以上合作时，按作者实际撰写字数计算各自工作量；如有异议，由著作第一负责人自主分配。若著作第一负责人为校外人员。按本校人员实际撰写字数计算。主编、副主编不再另有计分。
5、通过验收鉴定成果，新增加一项：对于其他类项目（即市厅级以下项目及横向项目）验收结题，每项计5分。
6、取消对延期结题项目的惩罚分：科研项目不能如期完成，但经批准同意其延期的(一般延期不超过一年)，在延期内按时完成的，可给予验收鉴定成果的工作量；如延期结束仍不能结题的科研项目，则不给予验收鉴定成果的工作量。
1、各部门单位下发并组织指导本部门教职员工根据修正办法填写《2008年个人科研工作量计算表》。此表一式两份，于6月1日前报送到部门。原未附上相关成果证明材料的，要补报相关材料。
2、所有涉及两人或多人合作的项目、成果(论文除外），均须由负责人填写《合作项目科研工作量分配表》，并分发给相关成员。此表一式两份，一份部门留底，一份连同《个人科研工作量计算表》(1份）由部门统一报送科技处。
3、 各部门及时收集、审核本部门老师填好的《个人科研工作量计算表》，并填写《2008年科研工作量部门汇总表》，连同《个人科研工作量计算表》及相关证明材料，于6月10日前报送科技处。
四、请各位老师及时认真如实填报，以便部门考核及科研奖励金能顺利发放。对未填报《2008年个人科研工作量计算表》的教师，视作无科研工作量；对无证明材料的项目和成果，不计算科研工作量。