本中心采常设性任务编组成立，层级与局处平行，下设规划执行、研究宣导组二组，并由“台北市政府心理健康委员会”作为专家咨询与指导单位。
规划执行组由卫生局主办，11局处兼办。重点任务为1.建立资源整合平台，2.进行自杀高危险个案整合***。
研究宣导组由卫生局辖下联合医院松德院区主办。重点任务为1.加强守门人训练与提供市民心理健康促进活动，2.定期学术研究发表与刊物出版。
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