实验室的空气中含有少量的氨气，这些氨气极易溶于水，使实验用水也不同程度地含有铵离子。在化验分析中，稀释水样所用的无氨水的制备和保存往往不被重视，导致外界氨氮溶解到水样中，会增加了水样的氨氮浓度误差.
氨氮的分析一般采用纳氏试剂光度法，显色要求碱性环境，但前处理过程较简单，进行显色测定后就能计算出结果。
总氮的分析前处理过程更复杂，在前处理过程中如果密封不好，会导致高温高压下氨氮释放，很少有化验室做到每次总氮的消解用生料带密封瓶塞的，因此转化不可能为*的转化这会导致总氮过程中的氨氮释放，引起误差
几乎所有的分析实验方法测定样品都有一定的方法误差 总氮和氨氮的实验分析也不例外分析氨氮的纳氏试剂光度法有误差分析总氮的碱性过硫酸盐分解法同样也有误差 两种分析方法误差给最后测定结果带来的误差有很大的不确定性。
在两个项目的整个分析过程中所使用的各种量器、比色管、比色皿等多种仪器它们都可能引入程度不同的误差;比色时所使用的分光光度计的灵敏度、精密度和准确度都可能不是一样的引入的误差大小也不一样。
数据处理中，两方面可能引入误差：一是不同的校正曲线引入的误差；二是对有效数字的取舍引入误差。
两方面的误差总和起来就形成了两分析项目间不小的误差。样品的浓度越小这种误差越大，这就是有些情况下，经过稀释的水样反而会出现氨氮小于总氮的情况。