妇女习惯性流产，除了染色体异常、内分泌异常、子宫构造畸形等常见原因外，有一种名为“抗磷脂症候群”的疾病，血中存在“抗磷脂抗体”，不仅容易造成动、静脉血管栓塞，还可能引起反复流产，一般人对此却很陌生。
所谓的抗磷脂抗体，包含LAC、aCL、a2GPI等抗体。这种疾病的成因尚不清楚，可分为原发性与次发性，原发性的发生几率较低，和其他疾病并无关联；而次发性则与某些免疫疾病有关，其中最常见的是红斑性狼疮。
根据国际抗磷脂抗体学会制订的规范，有栓塞病史，且有两次以上的抗磷脂抗体检测呈阳性，即可确诊为抗磷脂症候群，建议长期使用抗凝血剂来预防血栓，且应在确诊并发生第一次静脉血栓时，就开始口服抗凝血剂，使凝血功能的国际标准化比值（INR）维持在2到3之间。
如果确诊病患已发生动脉血栓，则建议口服抗凝血剂的治疗目标，应维持INR在3到4之间；通常INR值愈大，愈容易出血，正常人约在0.8到1.2之间。
不过，有些学者建议单用抗血小板药物或抗凝血药物，也有人建议两者并用，目前治疗准则尚无共识；至于这种治疗是否增加出血的风险，也仍有争议，不少研究认为，抗磷脂症候群所造成的伤害，远比出血风险高出许多。
研究指出，具有三种抗磷脂抗体的病患，比起只有一种抗磷脂抗体的病人，发生栓塞的几率高出许多倍。因此，针对高风险病人，需要更积极的治疗与监测；至于只有一种抗体呈阳性的病患，其栓塞几率和一般人差不多，所以治疗方式和一般人相同即可。
女性若抗磷脂抗体呈阳性，且经常性流产，建议可使用抗凝血剂“肝素”和低剂量“阿斯匹灵”，以预防再次流产；但口服抗凝血剂在怀孕后应即停用，以免造成畸胎。至于抗凝血剂的剂量，若是无任何栓塞病史者，建议使用预防性剂量即可；而曾有栓塞病史的女性，则应使用治疗剂量。
根据2012年美国胸腔科医学会所制订的治疗准则，女性符合抗磷脂症候群的血液诊断标准、且曾流产三次以上，就建议接受上述的药物治疗。而且患者一旦怀孕，便需要包括妇产科、风湿免疫科、血液科和新生儿科医师在内的完整医疗团队，共同提供照护。
由于目前尚缺乏大型临床研究报告，在开始上述治疗之前，病人应与医师详细讨论。而已确诊为抗磷脂症候群的女性，若曾有过正常生产、或第一次生产，可先密集追踪母亲与胎儿，暂时不必治疗；但可考虑使用低剂量阿斯匹灵，因为它有预防子痫前症的效果。
如果患者曾在怀孕十周以内流产、且无栓塞病史，第一线建议药物为低剂量阿斯匹灵，应在怀孕前开始使用。若曾在怀孕十周以上流产、且无栓塞病史者，建议同时使用低剂量阿斯匹灵与预防性肝素；如果治疗失败，则肝素要考虑改用治疗剂量。至于有栓塞病史者，则建议在准备怀孕时就使用治疗剂量的抗凝血剂。