重庆市农业科学院是以原重庆市农业科学研究所、市果树研究所、市作物研究所、市茶叶研究所、市农业机械研究所为基础，由重庆市人民政府于2005年12月批准成立的公益型农业科研事业单位。“八五”以来，全院获科技成果奖204项次，发表学术论文1400余篇，创新材料120多份，育成新品种80余个。其中，优质水稻育种进入全国先进行列，Q优6号和渝优600为国家认定的超级稻品种；玉米育种在西南地区处于领跑地位，渝单系列品种在全国推广运用；糯玉米育种居于全国领先水平，渝糯7号为国家糯玉米区试对照种；两系小麦材料创新、再生稻栽培等也居于全国领先水平；蔬菜育种、优质小麦育种、茶叶育种与加工、果树资源开发利用等领域也在西南地区保持领先水平；拥有蔬菜种质资源占全国总资源的四分之一、西南地区的四分之三；研制的“云岭永川秀芽”为全国唯一的针型名茶，为重庆十大名茶之一。直辖以来，推广水稻、玉米、小麦、蔬菜、茶树、果树等良种100多个，推广面积1200多万公顷，为重庆及周边地区农业和农村经济发展提供了强有力的科技支撑。学院在市科技特派员管理系统中注册有123人，派出“三区”科技人才54人。