在约拿书中，耶和华的言语不多，却行了好几个神迹。
耶和华呼召约拿去尼尼微宣教，劝尼尼微人悔改回转归神，但当约拿听到神的呼召，他并没有按照神所吩咐的去行，他原以为这可躲避神，而神是无的不知，无所不能的神。当约拿逃到船舱睡觉的时候，神的手就临到了约拿所乘坐的船上，神使大风击打约拿所坐的船。船上人都明白这约拿惹的祸，他必须自己承担这个责任，于是他接受了被扔进海里的管教。
神使人将约拿扔到海里，是为要管教约拿。神安排了一条大鱼把约拿吞。
约拿在灾难中寻求神，他在黑暗中向神祈求。神听了约拿的祷告，约拿在祷告中向神献上感恩和赞美，神要向尼尼微人施慈爱，要使尼尼微人脱离罪，耶和华神吩咐大鱼把约拿吐在旱地上。
神再次差派约拿去向尼尼微城去宣教，耶和华神说，你起来！往尼尼微大城去，向其中的居民宣告我所吩咐你的话。神并不强调约拿去全城所有的人宣告，只是向其中的居民，宣告神所吩咐约拿的，约拿有了第一次的经历，他不得不去对尼尼微人宣告神的话。尼尼微人听见了，就悔改且得到赦免。神免了他们的灾。
约拿看到尼尼微没有遭遇神所说的灾难，他的爱国情绪，民族主义情绪都如滔滔的江水，向神发涉，他觉得神没有满足他的心意，在他的身上看到人的自私自利的罪的本性。同时我们也看到神的慈爱，当神看到尼尼微人离开罪恶，神就饶恕了他们的罪。
尽管约拿对神发怒，但神仍处处章显他的慈爱，当约拿遭受到烈日曝晒时，神使蓖麻一的间长高，可以遮盖约拿的头，次日神使蓖麻神虫子咬死了。约拿又是发怒，耶和华对约拿说的这段话，这蓖麻不是你种的也不是你培养的，你且爱惜，何况这尼尼微大城十二万不会分裂辨左右的人，岂不爱惜呢？从神和约拿的对话中，看到神处处显出神是慈爱和公义的，祂有自己的主权，祂要恩待谁就恩待谁，要怜悯谁就怜悯谁。