业务一组掌理事项如下： 一、进口、邮递货物之通关。 二、进口税则预先审核及疑义案件之处理。 三、进口货物补税、免税、押款、退款、按月汇缴、先放后税、分期缴纳关税、暂准通关 案件及舱单之处理。 四、进口报单审核、副本核发及货物税完（免）税证明书之处理。 五、进口货物退运、调换、声明放弃之处理。 六、进出口货物查验及货样之管理。 七、进口报单管理。 八、违章及行政救济案件之处理。 九、其他有关进口通关、进出口货物查验及稽核事项。
机动仪检组掌理事项如下： 一、进口、出口、转运、转口货柜（物）之抽核、复验及仪器检查。 二、入出境旅客、航（船）员行李、邮递货物之抽核及复验。 三、情资搜集、分析及市面查缉。 四、货栈、货柜集散站、私货仓库、免税商店及保税相关处所货物之抽核。 五、电子封条监控系统之管理及维护。 六、货柜检查仪、辐射侦测仪等查缉设备之管理及维护。 七、辐射证照人员、仪器操作人员之训练及管理。 八、事后稽核案件之处理。 九、缉毒犬队执勤（搜索、侦测）及管理。 十、其他有关机动查缉及仪检事项。