(1)阳离子聚丙烯酰胺可以根据污泥的性质用于污泥脱水，可以在污泥进入压滤机之前有效脱水。在脱水过程中，会产生大的絮状物，这些絮状物不会粘附在滤布上，并且在压滤过程中不会分散。泥饼较厚，脱水效率高，泥饼含水率在80%以下。
(2)用于生活污水和有机废水的处理。本品在相容或碱性介质中呈正电性，对污水中悬浮颗粒带负电荷的污水有絮凝沉淀作用，使其澄清。比如粮食和酒精生产废水、造纸废水、城市污水处理厂废水、啤酒废水、味精厂废水、制糖废水、有机物含量高的废水、饲料废水、纺织印染废水等。阳离子聚丙烯酰胺的效果要比阴离子、非离子聚丙烯酰胺或无机盐高几倍或几十倍，因为这类废水一般都带负电。
(3)阳离子聚丙烯酰胺用作絮凝剂，用于处理以河水为水源的自来水。它具有用量少、效果好、成本低的优点，尤其是与无机絮凝剂配合使用时。它将成为长江、黄河等流域水厂的絮凝剂。