从目前爆发于德国的大肠杆菌中已经离析出两种品系,并在实验室里绘制及分析基因图谱。目前这两种品系可以在维吉尼亚生物资讯研究所及Pathosystems资源整合中心取得。因急于挽救生命,许多实验室正研究分析这些基因组并且提供数据给其他相关研究机构。
使用RAST注释此二基因组,让它们能和从PATRIC所取得的第184大肠杆菌基因组和总计2865种细菌基因组相符合。以被大肠杆菌感染的蛋白质来产生一个初步的系统演化树,是以166640个特征为基础,在354种类群转换成527个基因。这个演化树显示此二种新品系与具有肠聚集性的菌株有着高度的相关,对于它的起源可能有另外的观察。
PATRIC’s的主要研究者Bruno Sobral说:“PATRIC团队日以继夜的工作,希望能帮助科学界解决此紧急状况,并且提供高致病性毒株的起源观察分析和可能的应对策略。