离岛民政处宣布，鉴于天文台预测大澳会有严重水浸发生，特别为大澳居民而设的水浸预警系统现己动。天文台预测到在热带气旋影响下，大澳海平面高度可能在未来数小时内，达到海图基准面三点三米或以上，因此已经向相关部门或人士和村代表发出电话短讯，向他们发出预警。
政府各有关部门收到预警后，正调配资源应付可能发生的疏散及紧急援助工作，而村代表则协助将有关预警发放予其他居民，以便他们有充足的时间就水浸作准备及到安全的地方暂避。
大澳低洼地区的居民应在水浸来临前，到安全的地方暂避。警方、消防处、民众安全服务队人员，亦会在有需要时协助将受影响的居民疏散，到临时庇护站及安全的地方暂避。
受到台风及天文大潮影响，大屿山大澳再次出现严重水浸。
凌晨开始，海水不断上升，沿岸边涌入街路，水深一度近4呎，整个大澳都被淹浸。有10名居民曾经到附近社区中心暂避。
村民表示，与去年台风“黑格”造成的水浸相比，今次台风“巨爵”的影响较细。
离岛民政事务署、消防处、警方及其他部门，在大澳成立紧急协调指挥中心。水浸在天亮后逐渐退却。