2000年，中国原国家环保总局与意大利原环境、领土与海洋部（以下简称“意大利环境部”）签署合作协议，共同启动了中意环保合作项目。基于中意两国在绿色可持续科技领域的紧密合作，中意可持续发展中心（以下简称“中心”）于2012年由意大利环境部与同济大学签署协议合作设立。2014年，意大利环境部、中国科学技术部与同济大学三方共同实施同济大学运筹楼绿色生态改造项目。中心以运筹楼为起点，依托同济大学和意大利相关的专业资源，通过合作、对话、网络共建，为促进中意两国可持续发展的决策提供解决方案，打造中意技术交流、人才培养和科研成果转化的高端平台。

中意可持续发展中心由同济大学副校长及意大利环境部可持续发展司司长组成指导委员会，由意大利四所高校各1名教授及驻沪科技参赞、同济大学4名教授，共9名成员组成学术委员会。中心下设综合管理部、教育培训部、科研发展部、产学研合作部。