现代鸟类缺齿，咀嚼功能由砂囊代替。雌鸽在生殖时期，嗉囊壁能分泌“鸽乳”用来喂养雏鸽。鸟类的消化腺(肝、胰)很发达，它们分别分泌胆汁和胰液并注入十二指肠，参与小肠内的消化作用。家鸽无胆囊，而鸡、鸭等大多数鸟类都有胆囊。鸟类的消化能力强，食量大而不经饿，这是与鸟类飞翔时能量消耗大有关的。
鸟类的大脑、小脑、中脑都很发达。大脑半球较大，这主要是由于大脑底部纹状体的增大。在鸟类，纹状体是管理运动的高级部位，也和一些复杂的生活习性相关。鸟类的大脑皮层并不发达，小脑很发达，这与鸟类飞翔运动的协调和平衡相关。中脑在背部构成一对发达的视叶。