对于重现莱昂纳多的图书馆最为重要的文献资料，则是在其生平编辑的各种书单。1495年，莱昂纳多在米兰记下了大约四十余册的书，大部分是文学类和语言类。

佛罗伦萨，在1503年年末将至的时候，莱昂纳多的图书馆已经增加到116部书。颇具意味的是，大多由拉丁文写成的哲学、几何、科学、天文学、宇宙志和医学著作出现在图书馆中。

这是最为完整的一份书单，也许是莱昂纳多在佛罗伦萨的一次旅途中完成的，时间是在1503-1504年期间。实际上，该书单的书头有两条说明：“我锁在”修道院“抽屉里”和“柜子里的书的记录”（也许是新圣母教堂的修道院，莱昂纳多在那里从事《安吉亚里战役》的草图工作）。随着书架上的哲学类、科学类和技术类等书的增加颇具规模，（拥有一百十六卷书的）书单证明了莱昂纳多的知识视角的扩大。