国立嘉义大学系于2000年2月1日，由原国立嘉义师范学院及原国立嘉义技术学院两校整合而成。学校历史源远流长，发展与成长的过程与90多年来台湾经济、社会、教育的需要与变迁息息相关，脉脉相连。国立嘉义大学的诞生，满足了地方人士期盼一所大学的宿愿，也是台湾高等教育大学校院整合成功的首例与典范，为云嘉地区最具历史与规模的综合大学。
2012年2月1日邱义源博士接任第五任校长，以学校校训“诚朴、力行、创新、服务”为治校主轴，以德、智、体、群、美五育并进的校务发展目标为导向，持续改进校园的生态体质，提升教学、研究、辅导及推广服务的品质，传承努力、创新发展，落实学术殿堂“以知识服务社会，以科技引领进步，以人文美化生命”的理念，带领嘉大师生追求实践“光耀嘉义、扬名全国、跻身国际”的三大愿景与使命，让嘉大从“优秀”渐进转型提升到“卓越”（从A到A+）的境界。