负责研究所园区、办公室、实验室、宿舍及试验基地日常安全生产相关工作。 负责宣传、贯彻、执行国家和上级主管部门有关安全生产、消防等法律、法规及重要指示精神，制定研究所安全生产、消防等方面的管理制度及应急预案，组织执行、监督、落实。 制定研究所年度安全生产工作计划，组织签订安全生产责任书。 日常安全生产隐患排查、整改和设施维护，定期组织召开安全生产相关培训、讲座、消防演习。 负责研究所危险化学品在使用、储蓄、废弃处理等环节的安全管理。
研究所在安全生产技防设施建设上实现了出入大门车辆自动识别系统，所区办公室、实验室、试验基地等公共区域实时监控，配置了易制毒化学品及易制爆危险化学品专用仓库，建设了微型消防站、电动汽车充电桩、电动自行车和三轮车专用停车棚及充电桩等专用安全设施设备
2019年创新院院区环评通过深圳市生态环境局审核，研究所与“深圳市深投环保科技有限公司”签订《工商业废物处理协议》，实验室试验废液分类收集后可统一回收处理。
为加强研究所危化品管理，多次与公安部门协调，建设了易制毒化学品以及易制爆危险化学品专用仓库，并制定了《研究所危险化学品安全管理办法》、《易制爆危险化学品管理办法实施细则》以及《易制毒化学品管理办法实施细则》，目前研究所可正常采购易制毒化学品及易制爆危险化学品。