1998年11月，陕西省高新技术产业投资有限公司经陕西省人民政府批准成立（陕政字[1998]82号），1999年9月正式揭牌；
1999年——2005年底，作为陕西省投资集团的全资子公司，遵照《陕西省重大科技产业化项目投资与管理办法》，围绕省科教领导小组确定的省重大科技产业化项目计划开展投资业务。
2006年——2011年9月，按省政府决定，划归省国资委监管，主要完成开行政策性贷款项目、技改项目、陕南突破项目的投资及管理。2009年7月经省政府决定，将公司列为省科教领导小组的成员单位。
2011年10月至今，按省政府的决定，高**司划归陕西金融控股集团有限公司管理，成为陕西金融控股集团有限公司全资子公司。