恶心、呕吐：可以止吐剂减轻之。
口腔黏膜溃疡：用药后 3 ~ 7 天开始发生，请注意口腔卫生，多漱口，避免吃太烫、酸性等刺激性食物，症状严重，可以 Nysstatin 改善之。
肾功能受损：接受高剂量 MTX 时，如未给予适当的液体补充和碱化尿液，其代谢产物会直接对肾小管产生毒性作用。此期须特别注意水分补充，以维护肾功能。
掉发。
腹泻：可成为中止 MTX 治疗的指标，有严重胃溃疡患者，不应使用。
因对于肾功能异常或有积液导致 MTX 排除延迟的患者，在 MTX 给药 40 小时内给与 Leucovorin，可保护患者免于毒性作用。